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实验室设计应先于土建设计“构”应先于“建”，只有“构”清楚了，才可以开始“建”。就是用专业的手段将抽象构思进行具体实现的过程，包括实验室设计、安装、调试、维护和升级等。目前，我国对实验室的建设没有相关的建筑规范，因此很多实验室在土建设计阶段，没有充分考虑到实验室对建筑的特殊要求。正确的实验室建设流程是首先进行实验室的工艺设计，然后在满足实验室工艺要求的前提下，进行实验室的土建设计。这就要求建设单位咨询专业的实验设计方，在项目的土建设计阶段，就及时介入。如有可能最好带土建设计师一起参观其他单位的实验室以加深其认识。
实验室平面布局
实验室平面布局是实验室设计的基础，只有按照功能分区和工作流程的需求做好相应的平面布局规划才能确保后续的水、电、风等专业的设计，可谓牵一发而动全身。因此平面布局设计阶段应尽可能地详细考虑工作和发展的需求，合理配置空间，尽量优化整合。除了布局的优化和仪器设备的摆放位置的设计外，还应充分考虑到人员流动与物品流动的方向是否符合工作要求。例如，为了避免实验人员频繁跑动，前处理室应该和仪器室在同一楼层；气瓶室应和气相色谱仪、气质联用仪等仪器在同一楼层；尽量让单层面积最大化，以避免楼层过多，每一层都要设置洗涤室、样品室以充分利用空间；生物安全室应合理布局洁净区、半洁净区、污染区，以避免交叉污染。
供排风系统
实验室供排风系统是整个实验室设计和建设过程中规模最大、影响最广泛的系统之一。供排风系统完善与否，直接对实验室环境、实验人员的身体健康、实验设备的运行维护等方面产生重要影响。通排风系统完善的实验室，应该是环境和谐、安全、健康的工作场所。实验室噪音、房间的换气次数、压差、通风柜有毒气体残留等都是值得关注的问题。另外，样品室和试剂室也应考虑有通排风设备，以免样品带来的异味影响环境；一个现代化的实验室，应设计新风系统；通风柜前方的新风口散流器应采用可以调节方向活动室百叶设计，以避免冬夏季节外界冷热空气直接吹响操作者。
实验室家具
实验室家具的选择首先应考虑能充分满足工作所需，主要涉及到台面材质、柜体结构与材质、颜色搭配等要素。例如前处理室应采用耐酸碱的陶瓷板台面、仪器室应采用理化板台面等。台柜的结构主要分为钢木、铝木、全钢三种，实验台的支架又可分为C形、回形，应根据各个单位的需求而定。每个房间台柜的布局、种类、数量也要充分考量，边台、中央台、高柜、吊柜等应搭配得当，避免造成日后工作的不便。此外，还有一些细节也应考虑，例如电脑位合理配置，以避免将来使用的不便。
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